合成肽疫苗专利说明书(全)--表位问题

问：吴教授为什么不合成表面抗原、核心抗原表位（T.B.Th1)的氨基酸全序列？而只合成这些表位的部分氨基酸序列，再将他们组合在一起？如：核心抗原上第18-27氨基酸序列我们都知道是HbcAg的CTL表位，那141-151，117-215。。。都是什么？

答：HBV核心C基因在不同亚型间最为保守, 在它编码的180多个氨基酸中，CTL表位多位于第150位氨基酸（amino acid, AA）以前，其中18～27位AA为HLAA0201所限制，第88～96位AA被HLAA11所限制，第141～150位AA为HLAAw68和HLAA31分子所限制，此外第75～81位AA或72～88位AA是很强的构像型B细胞表位，因此核心抗原是比较理想的疫苗研究靶分子［4-5］.

在既往HBV疫苗研究中人们大多选用S基因编码的蛋白，并辅以CpG, IL2等分子佐剂试图达到免疫目的，但效果并不理想［6-7］.

而preS1基因编码蛋白含有HBV和肝细胞膜结合的位点，并且相当保守, 肝细胞、B细胞和T细胞均可表达针对其第21～47位AA的受体，故前S1抗体是除表面抗体外又一重要的中和抗体［8］. 因此HBV的C基因和preS1基因已经成为近年来HBV新型疫苗研究的重点［9］.

答：自身免疫病研究新策略：反向免疫学 吴玉章　 第三军医大学 2007-7-19 13:13:07

免疫组学和反向免疫学的研究进步，使我们能够从基因序列开始寻找疾病相关抗原、疾病相关免疫应答、可能的干预环节和干预策略，甚至干预手段。

在自身免疫性疾病，内源性危险信号启动了免疫应答或者说改变了免疫网络的张力和动力学，导致免疫损害。

因此，认识免疫系统与“非免疫系统”的对话（Cross-talk）机制和相互作用机理，是认识自身免疫病的基础。免疫组学和反向免疫学是从免疫组-疾病抗原组相互作用的角度认识、研究这一问题的。

既往的研究模式是从抗原找表位，我们提出“由表位如何构建模拟抗原（mimogen）调变免疫应答从而进行免疫治疗”这一问题。

将分子设计理论和技术引入免疫学，开展“免疫识别、分子设计与抗原工程”这一免疫学新领域研究，建立了病毒蛋白表位数据库和in silico 表位预测系列方法、实验探测系列方法；建立了基于表位设计mimogen的技术路线（epitope-based vaccine design，EBVD），形成反向疫苗的研究技术体系。

基于上述理论和技术，对系列蛋白质抗原进行了高分辨率的免疫识别研究，发现并鉴定了系列肿瘤相关抗原和55个优势性、保护性表位、模拟位，鉴定了“非溶破性CTL表位”(难道这就是传说中的"新的CTL效应机制"?)和超抗原表位，发现了CTL表位的异质性，提出了“CTL表位可按照功能分类”的新观点，并在蛋白质抗原识别方面提出新的识别理论——“蛋白质抗原免疫识别的氨基酸密码学说”。

在国际SCI收录期刊发表论著64篇。

为验证上述理论和技术，我们以乙型肝炎为模型开展反向治疗性疫苗研究。提出了“通过模拟抗原（mimogen）克服免疫耐受从而进行免疫治疗”的疫苗研究新策略。

反向免疫学的研究策略为自身免疫性疾病的研究提供了新的切入点。